（一）綜合部。負責公文管理、督查督辦、保密、法務、外事等工作；負責固定資產管理；負責大廈物業管理、消防、安全保衛等；負責后勤服務保障。

（二）政策理論研究室。開展兒童福利理論研究，收集、整理、研判國內外相關政策制度、研究成果和數據資料；參與有關學術交流活動；負責協調相關領域專家開展合作。

（三）兒童收養部。負責跨國收養資格審核、收養申請人與擬送養兒童匹配、相關文書寄發、檔案管理、安置后跟蹤服務等工作；處理被跨國收養兒童權益保護個案；負責被跨國收養兒童尋根回訪；承擔與海牙公約常設局、外國政府相關部門的溝通聯絡和情況通報等工作；參與起草民政部有關收養的規章政策等，并配合推進實施；承擔民政部要求開展的收養工作其他相關事宜。

（四）兒童福利部。承擔兒童福利相關具體工作，承接相關督導、評估、篩查等工作，推動相關政策貫徹落實；承擔“孤兒醫療康復明天計劃”辦公室相關具體工作，負責項目的日常管理、協調、聯絡工作。

（五）兒童保護部。承擔農村留守兒童關愛保護和困境兒童保障工作，承擔相關督導、評估、篩查等工作，推動相關政策貫徹落實。承擔民政部要求開展的其他兒童關愛保護相關事宜。

（六）兒童社會工作部。開展兒童社會工作實務，推動加強兒童社會工作專業建設，指導培育兒童社工督導和兒童社工骨干，推動提升兒童福利服務水平。動員社會力量，開展慈善公益項目，引導兒童類社會組織、志愿者提供關愛保護。

（七）兒童發展部。承擔中國兒童福利微信公眾號運維工作；承擔兒童福利領域標準化建設相關工作；承擔兒童福利從業人員執業技能建設相關工作；組織推廣兒童福利領域先進的成果、項目和經驗。

（八）信息宣傳部。負責孤殘兒童涉外安置信息系統的開發、管理、維護和培訓工作；負責辦公系統、網絡系統和視頻會議系統相關設備的技術支持和服務工作；負責信息安全技術保障工作和機房設備的管理維護；負責中心門戶網站維護，協助業務部門做好兒童福利相關理念、政策、法治的宣傳工作。

（九）財務部。負責會計核算，編制財務計劃；負責依法組織收入，合理安排支出；負責稅收管理與籌劃；負責招投標和政府采購的組織管理；嚴格財務管理；配合做好審計相關工作。

（十）黨委辦公室（紀委辦公室、人事部）。負責中心黨群工作，承擔黨委的綜合協調、學習教育、工作部署等日常工作和監督執紀等紀委日常工作；承擔中心人事管理、教育培訓及隊伍建設；配合做好巡視相關工作。